
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋白质组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研最终结果
科学研究拜谱生物蜡烛燃烧实验如今要在食品冷藏室保存日子增长鸡肉的硬度标准标准、持混流式水轮机、光亮、徘徊铁含氧量、ROS、脂质过阳极金属氧化物、MDA、GSH和GPX4平行来监测胸肌组织安排组织的铁去世模式。然而界面显示,要在食品冷藏室保存日子增长后,鸡肉的硬度标准标准在第六天和第6天偏态骤降;持水效率降底;配色变深,放弃光亮,鲜大粉红色转变成暗大粉红色。还有,徘徊铁、活力氧和MDA的含氧量偏态增长,组织凋亡率偏态变高。 探讨员工导出有对比冷冻冷藏时间间隔的身体肩部肌肉产品的合格品的球高血清,之后实行SDS-PAGE进行分析一下,球高血清条带在有对比年代分布图不均且类似的(图1a)。按照其球血清在有对比产品的合格品中的把你想表达出来情况下,进行分析一下发现了指定组产品的合格品的中个数一样于指定层次(图1b),讲解身体肩部肌肉产品的合格品球高血清都具有优秀的组内类似的性和组间对比性。 蛋清酶酶质组学共司法签定出1996种蛋清酶酶质。以B0为相较比较组,淘汰B1、B2、B4和B6中的蛋清酶酶确定的不同之处描述浅析,共司法签定到37七个DEPs。将火山图交互式,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05二个标准浅析DEP。成果下图1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别司法签定出22、33、73和140个DEPs,在其中分发型别上涨6、11、32和85个,变动16、22、41和55个。聚类分析方式 评估报告了的不同速冻过程肌群群组织安排中蛋清酶酶质的描述,成果出现肌群群蛋清酶酶描述的不同之处不断地吸收用时的不断增强而不断增强(图1g)。
图1| 区别保鲜时光的脂肪原材料营养素质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所差别速冻精力的相关肌肉产品的样品差别蛋清概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消失球蛋白肽的PRM定量定量分析定量分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG含有文化差异抒发血清的铁窒息死亡原则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT参考值淀粉酶酶质组学能力服务性保障,拜谱生物制品已商品研发完成任务并建造了加强制度建设旺盛期的转录组学、淀粉酶酶组学、分解组学已经多个学联席商品能力服务性保障网络体系,欢迎致电咨询!
参看学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.