
近日,武汉医科学校本科一、付属医生王学浩博士技术团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法卡路里代谢率检测分析服务。
英文怎么说大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
常常主题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业客户企事业单位:南京医科大学
钻研的原材料:细胞
拜谱出示精准服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物电量产生组
技术水平路线规划:
论述的结果
01、YBX1被监定为HCC中糖酵解的根本基因组
本理论研究终端采集HCC肉瘤样板(n=7)的单组织机构机构核RNA测序数据文件库集开始定量解析,发现了糖酵解吸附性重要集中在在肉瘤组织机构机构核中,hdWGCNA定量解析掌握出9个基因组信息模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的生活定量解析知道YBX1为自立生活危险重要因素重要因素(图1H)。进一大步结合起来IHC、WB检测和肉瘤组织机构机构与相邻非肉瘤组织机构机构的办公空间转录组学数据文件库集验证YBX1是肝组织机构机构核癌控制的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被制定为设定HCC细胞核糖酵解的要素原则
02、YBX1加快HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物力量代谢转化组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1紧密结合并可以淡化YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1综合并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化资料其磷酸性反应,而增进其核转位
进一大步查重YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是干扰其磷过酸,在OGT敲低的HCC组织细胞核中或用OGT限药品OSMI-1治理 ,YBX1淀粉酶质横向为正相关降,YBX1磷过酸为正相关抑制(图4A-C)。IP工作出现,在相等的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷过酸横向为正相关远超YBX1-T57A,抒发爱磷过酸的增大不仅是毕竟极高的YBX1淀粉酶质抒发爱(图4D)。分割了核和质类物质发掘TMG治理 的HCC组织细胞核中YBX1核抒发爱的身高(图4E-F),进一大步发掘YBX1磷过酸的重点控制系数是AKT(图4G-I)。一些发掘突出O-GlcNAc糖基化能够有利于推动其磷过酸来加强YBX1淀粉酶质安稳性并有利于推动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 遮盖有益于于其逐步骤发现磷酸性反应遮盖并会推进其核转位
05、YBX1增强PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1提高PKM2转录
06、YBX1 才可以加强组核蛋白乳碱化修饰语技术水平
学习知道YBX1敲低明显较低核膳食纤维乳硝凝成用,需要是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解控剂型2-DG的检测确认了糖酵解与组核血清乳硝凝成用的随便相关,控制糖酵解可明显较低H3K18la平行(图6D)。PKM2过把你想理解出来不可逆转转YBX1敲低所导致的的H3K18la急剧下降,到外源乳酸操作实际上优化H3K18la,还伴随着YBX1把你想理解出来上浮,表示会有正在向汇报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la可以通过生物富集于YBX1进行子随便利于其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化宏观调控(图6H-J),并知道P300 上浮是YBX1强化H3K18乳酰凝成用的共识机制(图6K-L)。
图6.YBX1提高H3K18乳硝化作用遮盖质量
好的文章个人总结
在这个研发中报道范文了YBX1在HCC中高表示,但是与糖酵解开切涉及到。YBX1在T57处被O-GlcNAc遮盖,然后安全稳定血清质并增多其表示。在这种遮盖还推动YBX1在T57处的磷过酸,推动其核易位。由此,哪一整个过程提高了糖酵解涉及到dna的转录并有趣乳酸的诞生。不仅,YBX1解锁P300的转录,以致驱动安装组血清的乳过酸,尤为是H3K18la,H3K18乳过酸双向调节YBX1dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正反两面馈环逻辑图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法消耗的能量分解代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白质组学、讲述后突显组学、代谢转化组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
决定性文章
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.