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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 最新产品推出|乳酸性反应的逆袭吧哥们,衣康酸性反应淡化蛋白质组高冷席卷而来!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一种为化工行业原科而被询问的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收有害垃圾”成為“寻宝小原子”的心路之路之路类似的,陪你到近二很多年里才被感觉其重点的生物工程学作用,此后“平躺农奴把独唱”,尤其是是在免疫力慢性炎症病变性症状的研究前沿技术内异军突起。已经在的好几篇文献资料消息了在繁多慢性炎症病变性症状的猎物模式化中受到衣康酸或其生物体现衍生品物工程的治愈益处,并感觉其暗藏靶点。关与衣康酸的“前生”与“此生”,详情微信推文《乳酸的逆袭女神周围人——衣康酸!本文让你一起去流浪询问衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸淡化球蛋白组学产品,实现1000+什么难以理解的度遮盖位点检测出,稳定可靠再次出现经典爱情靶点,全位置生信解析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“证实”全注意事项服务质量,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、检测流程步骤

02、亲测统计数据

03、经“点”初现

在实际数据分析中,验出多家论文参考文献中新闻稿的典型靶点极其衣康酸呈现位点,如第二个被发现了的衣康酸共价呈现蛋清KEAP1,各类糖酵解信号通路中的3个根本酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各类炎性小体组合成蛋清NLRP3和肿瘤细胞挫裂工作中的根本蛋清RIPK3等,其质谱图详细图右图。

04、的产品优缺点

1.很多质控

服务业化特情人测试探针孵育、SDS-PAGE在线查重、WB验正、子样本涉及到的性概述等各个位在线查重,为了确保品牌成果信得过性。

2.高耐磨性质谱器材渠道

在Orbitrap Astral全新第二代高辩认质谱仪支持下,实现了衣康硝化作用体现位点及蛋白质评定新厚度,助推专业设计新找到。

3.全操作流程一走式工作

依托于拜谱怪物健全完善的实验英文工作平台,可提拱“神经元培育→查重器孵育→WB查重→高妙度衣康碱化装饰查重→个性化生信分折→不同位点PRM确认”全工作流程服务性,省时更省心更更省心。

05、浅析信息内容(部位)

06、软件应用方向上

PART 2、专著分析

论文一

英文音标主题词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

繁体中文宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

分析信息:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

参考文献二

英语翻译宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名字版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

实验內容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、案例库衍生物指导思想

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13体现了更强的底物融入本事,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物工程衣康硝化作用突显组实测值数据库中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸修饰语(如下所述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

是 TCA反复中的其中排泄物,衣康酸调节器排泄、天然免疫抗体系统和急病症状内的相护技能,为开展天然免疫抗体系统急病症状类急病症状打造了替代品开展机制。衣康酸格局中的亲电性α,β-不饱和点羧酸格局能对蛋白酶质上的活力性半胱氨酸残基去烷基化绘制(迈克尔暴击伤害不良反应),某一泰语翻译后绘制被可称“衣康酸绘制(itaconation)”,因此影向蛋白酶质技能,调空天然免疫抗体系统对答和排泄路径,为种急病症状药研制打造新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学专业决对按量靶点产生组(QMT1000)或养分产生率靶向治疗产生率组物品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参看论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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